La «boucle microbienne» (BM) du sol est une fonction écologique clef des écosystèmes assurée par les interactions entre les racines, les bactéries, et les bactérivores du sol, dont les nématodes. Plus précisément,l’action des nématodes bactérivores permet d’augmenter la phyto-disponibilité des nutriments en libérant des nutriments bloqués temporairement dans la biomasse microbienne. La maîtrise de cette fonction des sols pourrait constituer une alternative agronomique significative pour améliorer la fertilité minérale des sols à Madagascar qui est l’un des principaux enjeux de la réussite de la riziculture pluviale. Pourtant, aucune étude sur la BM n’a été réalisée à Madagascar. Dans l’objectif d’étudier l’effet des pratiques culturales du riz pluvial (choix de la variété, le type de fertilisation, association ou rotation) sur la BM, deux expériences en microcosmes ont été conduites: (i) croissance de huit variétés de riz pluvial (Oryza sativa) dans du sol défauné par autoclavage, (ii) croissance de la variété B22 dans des carottes de sol en place prises sur 9 parcelles (Imerintsiatosika) en système de riz pluvial puis défaunées par fumigation. Pour chaque expérimentation, deux traitements ont été comparés: inoculation avec des bactéries seules (B), inoculation avec des bactéries et nématodes bactérivores (B+N). A la fin des expérimentations, la biomasse, la teneur en azote dans la plante et le nombre final de nématodes ont été mesurées. Les résultats de la première expérience ont montré que seule la variété (B22) répond positivement à l’action des nématodes bactérivores en présentant le meilleur rapport d’allocation de biomasse entre le compartiment aérien et le compartiment racinaire. Les observations de la deuxième expérience ont montré que les effets des nématodes sur la croissance et la nutrition du riz pluvial peuvent être positifs, neutres ou négatifs en fonction des paramètres environnementaux (pH) ou des paramètres agronomiques (présence d’arbre, association avec une légumineuse). En conclusion, cette étude montre que la BM est une fonction importante des sols qui peut être optimisée en fonction des pratiques au sein du système de culture de riz pluvial à Madagascar.